El principal objetivo de Basquetour es impulsar el ecoturismo en Euskadi y mejorar la gestión y la visibilidad del producto en el destino, además de incrementar el número de empresas que aplican los atributos del ecoturismo y que cumplen los requisitos del Club Ecoturismo en España y que, por lo tanto, contribuyen de forma efectiva al desarrollo local y a la conservación de la biodiversidad en Euskadi.
Para garantizar dicha contribución a la conservación de la naturaleza y al desarrollo local en los territorios donde se ubican estos alojamientos, se ha contado con la participación un técnico de la Sección de gestión de Espacios Naturales Protegidos del Servicio de Patrimonio Natural de la Diputación Foral de Bizkaia, Álava y Guipúzcoa, quienes han explicado la importancia de las empresas turísticas a la hora de dar a conocer los valores de los espacios naturales, informar sobre normativa de uso público y restricciones vigentes en los mismos y, especialmente, mejorar la calidad de la visita y la experiencia de los visitantes.